تثبيت نيتروژن توسط بعضي باكتريهاي خاك كه ريزوبيوم نام دارد و در گياهان و بقولات وجود دارد انجام ميشود و از زماني كه نقش ان براي تثبيت نيتروژن شناخته شد در كشاورزي اهميت پيدا كردند و در سالهاي اخير طبقه بندي انها تغيرات زيادي كرده است. تا سال 1980 ريزوبيوم ها در 6 گونه ي زير طبقه بندي شدند:R.legumimos , R.japonicum ,R.meliloti, R.trifolii ,R.phaseoli ,R.lupini
سپس تكنيك هاي مولكولي در طول 20 سال گذشته به طور قابل توجهي توسعه يافتند و براي توصيف ريزوبيوم قابل دسترس قرار گرفتند كه منجر به تغييرات زيادي در طبقه بندي انها شد.
علم رده بندي كه روابط طبيعي بين موجودات را مطالعه مي كند و انها را به طبقه بنديشان سوق ميدهد رده بندي فيلو فاسيك نام داردكه شرط لازم براي اين طبقه بندي ويژگي هاي موجود ميباشد. مفهوم مركزي علم رده بندي باكتريايي گونه هاي باكتريايي ميباشد.امروزه طبقه بندي باكتريايي بايد روابط فيلوژنيك بين باكتري ها را براي اينكه انها شناخته شوند انعكاس دهند .colwell اساس علم رده بندي باكتريايي جديد را پايه ريزي كرد.او با كامل كردن تكه هاي اطلاعات به دست امده طبقه بندي ويروس ها از فنوتيپ سلولDNAوRNA و اظهار كردن شكل انها اساس علم رده بندي باكتريايي را پايه ريزي كرد.هر تكنيك مورد استفاده در علم رده بندي توان تبعيض خودش را دارد و از نظر گونه جنس خانواده و طبقات بالاتر زمينه ي تقاضا شرايط خاص و تعداد وقوع نژاد ها مجزا ميكند.
در رده بندي كنوني ريزوبيوم ها انها باكتري هاي گرم منفي و ميله اي هستند و از لحاظ فيلو ژنيكي انها به تفكيك فرعي يا بخش جزيي تر الفا پروتو باكتري ها تعلق دارد. گونه ي ريزوبيوم براي اولين بار به دو دسته طبقه بندي شد و اين طبقه بندي در مورد جنس ريزوبيوم كه شامل نژاد هاي در حال رشد سريع و گونه جديد بر روي ريزوبيوم و براي رشد كند انها تشكيل شد.
الف)شاخه ي ريزوبيوم و اگروباكتريوم:شامل چندين زير شاخه است كه هر كدام با چهار جنس ريزوبيومي تطابق دارند كه با ساير گونه ها ادغام شده است.اولين زير شاخه با S.3گونه ريزوبيوم. دومين زير شاخه با گونه ي sinorhizobiumسومين زير شاخه با گونه ي mesorhizobium تطابق دارد.
ب)شاخه ي ازو ريزوبيوم:كه براي ريزوبيوم جداسازي شده از ساقه ي بقولات گرمسيري خلق ميكند.
ج)شاخه ي برادي ريزوبيوم:گونه ي Bكه شامل ريزوبيوم با رشد كند براي مدت طولاني شرح داده شده بود و ان تنها شامل يك گونه بود B.joponicmكه شامل نژاد هاي گره دار شده از سويا بود.
به هر حال HOLLIS نشان داد كه گروه انها هتروجنس هستند و سه گروه DNA را نشان مي دادند. در طول سالهاي گذشته گروههاي زيادي ازگونه ي برادي ريزوبيوم ها با فنوتيپ ويروس ها ويژگي انها و روش هاي ژنوتيپي شناخته شدند.